柳纪纲介绍，全市污水直排量大，城乡结合部黑臭水体集中，约占中心城的90%，坝河下游、常营等朝阳、海淀、丰台等人口密集区河流黑臭。他说，河湖水质堪忧，2010年至今，北运河主要污染物指标逐年上升，其中COD(化学需氧量)、BOD(生化需氧量)分别上升30%和52%;清河、通惠河等主要河流枯水期、平水期、丰水期均为劣五类水质。
地下水污染同样严重。柳纪纲说，北京浅层地下水四类、五类水质占平原面积50%，深层地下水四、五类水质占监测面积20%。雨污合流比重高，全市排水管9147公里，雨污合流管道占24%。
究其原因，检查组认为，断头路妨碍管网效率，新建小区污水收集缺少“最后一公里”支户管，如石景山区某地，1万人每天约1000吨污水直排莲石河;农村设施严重不足，中心城城乡结合部规划人口40万，实际超400万，仅有681个村建了1040座污水处理设施，覆盖率不足20%;河流周边村、水源地村、民俗旅游村和养殖村排污亟待治理。
北京市水务局表示，将对污水管网未覆盖的城乡结合部、居住小区等地，建设污水临时收集设施杜绝污水直排;严格开发建设项目配套水污染防治设施建设;划定河湖水生态保护红线。市水务局称，计划年底前出台《北京市排污许可证管理暂行办法》。
据了解，水污染增加了水厂治污成本，但民众饮用水质并未受到影响。饮用水源地环境状况评估显示，北京水源地达标率在99%以上。
根据《地表水环境质量标准》，一类地表水适用于源头水、国家自然保护区;二类地表水适用于集中式生活饮用水地表水源地一级保护区、珍稀水生生物栖息地等;三类地表水适用于集中式生活饮用水地表水源地二级保护区、水产养殖区等渔业水域及游泳区;四类地表水用于一般工业用水区及人体非直接接触的娱乐用水区;五类地表水适用于农业用水区及一般景观要求。劣五类水质意味着污染程度已超五类水。